多组学分析

      肌肉是任何肉制品的主要成分,其生长性能和产品质量是现代育种的核心。泰和乌骨乌鸡是乌鸡的代表品种,乌鸡肉是我国药食同源的特色畜产品,具有很大的开发应用价值。然而,泰和乌鸡肌肉中的营养成分和潜在的基因/蛋白质生物标志物仍知之甚少。为了探索鸡肉生长的分子机制,我们基于TMT的定量蛋白质组学和RNA-Seq方法对肌肉的转录组和蛋白质组进行了综合分析。首先,通过RNA-Seq分析发现,泰和乌鸡和青壳蛋相比,286个基因上调,190个基因下调。KEGG和GO富集分析表明,泰和乌骨鸡的氧化还原酶活性和电子转移活性在上调基因中显著富集,而磷脂稳态和胆固醇转运蛋白活性在下调基因中显著丰富。其次,蛋白质组分析表明,泰和乌鸡肌肉中186个蛋白质显著增加,287个蛋白质显著减少。DEPs的功能富集和网络分析表明,线粒体功能和氧化磷酸化是泰和乌鸡的主要变化途径,这是提高肌肉抗氧化能力的两个关键代谢途径。最后,综合转录组和蛋白质组分析在泰和乌鸡中鉴定出6个重叠的上调基因(CBFB、POSTN、AGPAT2、CRP、METTL7A和MTPN)和8个重叠的下调基因(CYTB、AMPD1、CARNS1、CKMT2、PCCB、DUSP26、IDH3A和FN3K)。这些候选基因和蛋白质被鉴定为与泰和乌鸡肌肉抗氧化状态的改善有关。总之,本研究为鸡肌肉抗氧化能力的分子机制提供了新的见解,为提高泰和乌骨乌骨鸡的生长性能奠定了科学基础。

Table S1. The up-regulated and down-regulated genes identified in the Taihe Silky fowl by RNA-Seq analysis.xls

Table S2. The differentially proteins identified in Taihe silky fowl by proteome analysis.xls

     Figure 1.jpgFigure 2.jpgFigure 3.jpgFigure 4.jpgFigure 6.jpg

咨询电话
0796-8106182
公司地址:江西省吉安市青原区学苑路28号-吉安市泰和乌鸡遗传育种与繁殖重点实验室
邮箱:xinjun_liao2022@126.com
淘宝店铺:
Copyright © 2023 吉安市泰和乌鸡遗传育种与繁殖重点实验室 All Rights Reserved. 赣ICP12345678